学校设有三个系：生命与地球科学系、语文与历史科学系以及宗教科学系。学院本部设在巴黎，生命与地球科学实验室分布在巴黎大区和外省各地（第戎、里昂、格勒诺布尔、蒙彼利埃、图卢兹、波尔多等）。巴黎高等研究实践学院可以颁发硕士与博士学位，以及博士后的特许任教资格，其开设的硕士专业有生物信号设备与集成系统、环境与生物多样性管理、复合系统、自然认知与人工认知、认知心理学、亚洲研究、艺术史与考古学、宗教与社会科学等；博士专业集中在三大领域，分别是集成系统、环境与生物多样性、宗教与思维方式、历史与文献。巴黎高等研究实践学院是索绪尔语言学派（索绪尔-居斯塔夫纪尧姆-海然热）、年鉴学派（Annales）、结构主义（Structuralism）、符号学派（Semiotics）的大本营。
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